目前国内生物柴油主要通过加油站等途径用于运输交通消费，为了方便资源管理，达到节能减排的目标，有关部门因此取消了对生物柴油的消费税豁免政策。不过，财政部流转税处有关人士表示，政府鼓励废弃资源的综合利用，近日已出台增值税减免等的优惠政策鼓励生物柴油发展，因此消费税征收不排除是个短暂措施，以后或会减免，有关部门对生物柴油的税收优惠仍在研讨之中。

针对当前传出的生物柴油或仍将征收消费税的消息，四川鑫得利车用燃料有限公司董事长、中国新能源协会常务理事冯世和称，他们公司主营醇醚能源，所以目前并不会有任何影响。作为新能源制造商，他们公司还享受到三年的免税优惠。但是四川部分生物柴油供应商昨日晚间告诉记者，目前消息尚不能够完全证实，但是如果征收消费税的话，对他们肯定是有影响的，他们希望国家在生物柴油方面的政策能够继续有所宽松