舟山的市情，决定了海洋渔业资源是舟山经济赖以生存和发展的基础。2007年9月舟山市委、市政府召开的全市渔业大会，提出“要坚持渔业的基础地位不动摇，要坚持转变渔业发展方式不动摇，要坚持强化海洋管理与发展现代海洋渔业并重不动摇。”把建设全国一流的现代化渔业基地，作为今后的指导思想和发展目标。实现这个目标，需要重点做好以下工作：
　　调整结构，提升素质，继续转变发展方式
　　渔业特别是捕捞渔业属于典型的资源约束性产业，发展渔业既要考虑当代人的需求，还要顾及子孙后代的生存需要。过去认为产量越高、规模越大就是发展，不符合科学发展观的要求，今后的方向是提升科技含量、提高产业素质、做精做强渔业。在捕捞方面，总量继续调减，尤其压缩近海捕捞，计划到“十一五”末捕捞渔船由7400艘减至5000艘，捕捞渔民由6.3万人减至5万人；鼓励发展远洋渔业，尤其是大洋性渔业，支持海上加工船的配套发展，建设海外渔船保障供给基地；打造捕捞渔船过硬、捕捞队伍过硬、装备设施过硬、竞争力强的现代捕捞渔业。在养殖方面，划定滩涂保护区，实行规模化集约养殖，推行生态健康、高产高效养殖模式，同时研究推广浅海抗风浪网箱养殖。在休闲渔业方面，政策上扶持、资金上支持，加快培育一批休闲渔业基地和休闲渔村，结合舟山日趋兴旺的旅游经济，让这一亮点更亮。在加工方面，“中国渔都”的资源、市场、旅游食品等潜力优势巨大，关键在于壮大龙头企业。
　　高度重视渔业基础设施建设
　　渔业基础设施是发展现代渔业的重点保障，也是舟山渔业需要加强的薄弱环节。“十一五”期间各级政府财政计划投入20多亿元，规划建设渔港工程，实现全市95%以上渔船就近安全避风。要着力推进中心渔港及渔港经济区建设，加强其要素集聚、产业拓展、服务保障等功能，充分发挥对渔区经济和新渔村建设的拉动作用。要着力推进养殖设施改造，抓紧开展养殖鱼塘的标准化改造，发展工厂化养殖设施。